Informațiile despre unde se afla exact capitala Macedoniei Antice au fost înregistrate pentru prima dată de Herodot în cronicile invaziei persane a Greciei. Pe vremea aceea nu aparținea încă macedonenilor, dar în timpul domniei lui Alexandru I, care și-a întărit influența datorită perșilor, orașul a fost inclus în Macedonia. Aparent, după invazia tracilor, Pella a fost aleasă ca capitală, deoarece orașul este situat chiar în inima ținuturilor macedonene și era bine protejat.
La începutul secolului al IV-lea, odată cu întărirea influenței Macedoniei Antice în lumea elenă, Pella s-a dezvoltat semnificativ și a devenit cel mai mare oraș al statului. Fosta capitală a Aegis a rămas, totuși, centrul cultural al Macedoniei. Regele Archelaus, care a domnit între 413 și 399 î.Hr. a construit un palat maiestuos în Pelle și l-a invitat pe artistul Zeuxis să-l picteze. Este interesant că în acele vremuri macedonenii înșiși numeau chiar și micile fortărețe orașe, în timp ce ei înșiși preferau să trăiască la țară. Din acest motiv și din alte motive, grecii antici i-au tratat pe macedoneni cu dispreț, considerându-i barbari, dar această structură a societății le-a permis macedonenilor să creeze cea mai numeroasă și puternică cavalerie din toată Grecia Antică, în timp ce toate statele elenistice se bazau pe infanterie în bătălii.
În secolul al II-lea î.Hr e. romanii au spart în cele din urmă rezistența macedonenilor și au cucerit statul. De atunci, capitala Macedoniei Antice și-a pierdut independența, rămânând doar unul dintre cele patru centre administrative din toată Macedonia. Mai târziu, romanii au preferat să stabilească centrul regiunii în orașul Salonic, drept urmare Pella și-a pierdut din importanță și a fost abandonată. În secolul I î.Hr e. orașul a fost în cele din urmă distrus de un cutremur, iar rămășițele sale au fost descoperite de arheologi în 1914.