Fenomenul de electroforeză capilară are loc în soluții care sunt plasate într-un câmp electric cu în mare parte tensiune înaltă. Dacă soluția este situată într-un capilar subțire, câmpul electric aplicat de-a lungul capilarului stimulează mișcarea particulelor și fluxul pasiv al întregului lichid. Ca rezultat al acestei proceduri, proba va fi împărțită în componente separate, deoarece fiecare tip de particule are propriii parametri de electromigrare specifici.
Cu toate acestea, factori de perturbare precum difuzia, sorbția, convecția, gravitația și alții sunt mult mai slabi în capilare, ceea ce contribuie la o distribuție mult mai eficientă.
Metoda electroforezei capilare este utilizată pentru a analiza diferite substanțe și obiecte, precum cationi metalici, anioni anorganici și organici, aminoacizi, vitamine, medicamente, pigmenți și coloranți, proteine, peptide. Această metodă este utilizată pe scară largă în analiza produselor farmaceutice și a produselor alimentare, controlul calității apei și băuturilor. De asemenea, controlul tehnologic al producției și controlul intrărilor de materii prime nu pot face fără el. Printre domeniile care folosesc în mod activ electroforeza, criminalistica, medicina și biochimia ar trebui să fie evidențiate.